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用iTOL网站快速绘制颜值最高的进化树！
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2024/11/24 11:59:18
论文模型构建的步骤_构建进化树---核苷酸替换模型的选择
在进行系统发育分析时需要通过构建系统发育树来描述不同物种之间的进化关系，通过同源DNA的核苷酸序列或者同源蛋白质分子的氨基酸序列可以实现构建进化树。在系统发育分析中，最大似然法（ML）和贝叶斯法（BI）是对替换模型非常敏感的两种算法，因此利用ML法或BI法重建系统发育…
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2024/11/24 12:02:52
【转】MEGA构建系统进化树的步骤(以MEGA7为例)
本文是看中国慕课山东大学生物信息学课程总结出来的 分子进化的研究对象是核酸和蛋白质序列。研究某个基因的进化，是用它的DNA序列，还是翻译后的蛋白质序列呢？序列的选取要遵循以下原则：1）如果DNA序列的两两间的一致度…
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2024/11/21 15:29:26
iTOL快速绘制颜值最高的进化树！
iTOL简介 大家在看高分文章时，总会惊叹于，为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树，而且好看的图也能直接提升文章的档次，冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔，而你每次花了半个…
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2024/11/21 18:22:53
iTOL：快速绘制超高颜值的进化树！
iTOL简介 大家在看高分文章时，总会惊叹于，为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树，而且好看的图也能直接提升文章的档次，冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔，而你每次花了半个…
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2024/11/21 21:13:55
用 phylomatic 软件生成的进化树
用 phylomatic 软件生成的进化树 Phylomatic是在线软件，可以利用植物名录，按照APGIII的被子植物科的拓扑结构，生成进化树。 参考 张金龙博士 工作目录 setwd("E:\\my_research\\my_scripts\\植物转录组发育进化树") 安装 plantlist install.packages("E:/my_…
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2024/11/14 1:02:14
itol绘制高颜值的进化树
iTOL简介
大家在看高分文章时，总会惊叹于，为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树，而且好看的图也能直接提升文章的档次，冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔，而你每次花了半…
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2024/11/14 1:02:07
linux系统发育树的构建步骤,步一步教你如何做系统进化树
我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用范围。这几个软件分别是PHYLIP、PUZZLE、PAUP、TREEVIEW、CLUSTALX和PHYLO-WIN(LINUX)。 在介绍软件之前，我先简要地叙述一下有关进化树分析的一些方法学问题。 进化树也称种系树，英文名叫“Phyligenetic tree”。对于一个完…
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2024/11/14 1:02:14
