相关文章
【转】MEGA构建系统进化树的步骤(以MEGA7为例)
本文是看中国慕课山东大学生物信息学课程总结出来的 分子进化的研究对象是核酸和蛋白质序列。研究某个基因的进化，是用它的DNA序列，还是翻译后的蛋白质序列呢？序列的选取要遵循以下原则：1）如果DNA序列的两两间的一致度…
建站知识
2024/11/21 15:29:26
iTOL快速绘制颜值最高的进化树！
iTOL简介 大家在看高分文章时，总会惊叹于，为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树，而且好看的图也能直接提升文章的档次，冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔，而你每次花了半个…
建站知识
2024/11/21 18:22:53
iTOL：快速绘制超高颜值的进化树！
iTOL简介 大家在看高分文章时，总会惊叹于，为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树，而且好看的图也能直接提升文章的档次，冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔，而你每次花了半个…
建站知识
2024/11/21 21:13:55
用 phylomatic 软件生成的进化树
用 phylomatic 软件生成的进化树 Phylomatic是在线软件，可以利用植物名录，按照APGIII的被子植物科的拓扑结构，生成进化树。 参考 张金龙博士 工作目录 setwd("E:\\my_research\\my_scripts\\植物转录组发育进化树") 安装 plantlist install.packages("E:/my_…
建站知识
2024/11/14 1:02:14
itol绘制高颜值的进化树
iTOL简介
大家在看高分文章时，总会惊叹于，为什么人家能做出那么好看而且高大上的系统发育树，而且好看的图也能直接提升文章的档次，冲击高分文章。人家的树不管是从配色还是各种注释信息都让人无可挑剔，而你每次花了半…
建站知识
2024/11/14 1:02:07
linux系统发育树的构建步骤,步一步教你如何做系统进化树
我在此介绍几个进化树分析及其相关软件的使用和应用范围。这几个软件分别是PHYLIP、PUZZLE、PAUP、TREEVIEW、CLUSTALX和PHYLO-WIN(LINUX)。 在介绍软件之前，我先简要地叙述一下有关进化树分析的一些方法学问题。 进化树也称种系树，英文名叫“Phyligenetic tree”。对于一个完…
建站知识
2024/11/14 1:02:14
R绘制优美的进化树（进阶）
上次已经介绍过了使用R绘制系统发育树的基本用法，也埋下一个小坑：复现文章里好看的树，现在过来填坑了，哈哈哈。
我准备了一些文章里自己觉得很不错的树（当然尽可能风格不同），然后自己生成随机的…
建站知识
2024/11/14 1:02:11
生信漫谈如何利用MEGA7构建系统进化树
前言
生物技术近年发展越来迅猛，掌握一门生信语言或者一个生信软件的使用，这将为我们的科研学习之路提供非常大的便利。今天我们主要来介绍如何用MEGA7进行进化树。
1、下面以MEGA7为例来进行讲解，下面是下载地址，大家根据自己的…
建站知识
2024/11/14 1:02:08
