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1. 将 SNP 文件转换为 phylip 格式
用 tassel 的格式转换功能将 plink 格式转为 phylip 格式。 另外有一个脚本可以将 vcf 格式转换为 phylip ,vcf2phylip.py
run_pipeline.pl -Xmx5…
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2025/1/29 8:01:14
把clinvar转换为annovar的格式
下载最新的数据库:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/clinvar/vcf_GRCh37/
annovar是注释用的比较多的软件,clinvar的数据库经常更新,要跟的上更新,就必须自己进行格式转换,也可以把自己的数据库放在annovar注释&#x…
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2025/1/29 4:41:37
Excel转成vCard(vcf格式)的5种方法 | 古意人
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>> Excel转成vCard(vcf格式)的5种方法 | 古意人 Excel转成vCard(vcf格式)的5种方法 2014年10月10日 ⁄ android ⁄ 共 972字 ⁄ 字号 小 中 大 ⁄ 暂无评论 工作中我们可能会碰到将电脑的excel通讯录导入到手机的情况,…
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2025/1/29 6:38:20
单倍型分析过程,旧+新,2.0版本(上)
开学时候做的东西,现在再添加的新的,经过一段时间的沉淀,我重新跑一遍,等会在完善一下文章吧。
参考文章:
科学网-PopART 绘制 Haplotype Network 图解(By Raindy)-高芳銮的博文 (sciencenet.cn)
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2025/1/29 6:37:19
excel转vcf格式通讯录的批量方法
简介 因为工作中接触的客户比较多,我通常习惯使用Excel表格来存放我的通讯录。但当通讯录的人越来越多的时候,手动添加到手机就不太现实了。 讲一讲我今天找到的一个Excel表格文件转vcf通讯录文件的方法吧。适合批量Excel转换vcf格式。 也许有些人不知道…
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2025/1/29 6:36:59
Annovar软件注释肿瘤基因突变(一):COSMIC数据库最新版下载与使用
COSMIC,即:Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer。官网: https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic 注意事项: Cosmic 数据库从 v71 版本开始,学术研究免费(需要学校或研究机构的邮箱注册)&…
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2025/1/29 10:24:27
excel文件怎么转成vcf_批量excel转vcf格式的方法
我们的日常工作中,总是习惯性的用excel来放有些数据,比如公司的联系方式,客户的联系方式。但有时候我们又想把它导入手机。这个时候我们应该怎么办?一般我们想导入手机通讯录,得先把excel转换成vcf。那么excel文件怎么…
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2025/1/29 6:37:56