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2025/1/24 2:21:12
[病理图像质控]分割病理图像(whole slide images,WSI)中包含组织的区域,去掉空白区域
文末有代码链接!!!!!
修改 2023-03-14
偷空写个帖子。 在处理全病理切片(WSI)的时候,经常会碰到一个问题。就是整个WSI很大,其中有很多空白的地方,深度学习…
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2024/12/26 9:24:15
质控软件fastp常用参数说明
文章目录 写在前面参考文献fastp功能类似软件比较简单示例常用参数说明UMI去除质量过滤长度过滤低复杂度过滤adapter过滤通过质量值过滤每条readployG/ployXPE数据的碱基校正整体切除 【global trimming】输出文件切分过表达序列分析 fastp和Trimmomatic的优势/劣势-chatGPT 写…
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2024/12/26 9:26:35
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2024/12/27 8:05:00
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2024/12/27 0:42:44
【bioinfo】学习使用一款数据质控软件(Trimmomatic)
文章目录 写在前面参考文档软件使用执行命令参数说明 修改日志 写在前面
Trimmomatic工具是用于illumina二代测序数据的reads处理,主要对接头(adapter)序列和低质量序列进行过滤。下面是使用该工具处理双端测序(PE)数据时,常用参数的一些说明。
参考文…
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2024/12/26 9:22:15
医院检验科LIS系统源码,oracle数据库、报告管理、质控管理
LIS(全称Laboratory Information Management System),是专为医院检验科设计的一套实验室信息管理系统,能将实验仪器与计算机组成网络,使病人样品登录、实验数据存取、报告审核、打印分发,实验数据统计分析等…
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2024/12/27 0:46:42
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1引言 各位做生信的小伙伴都知道,对于下机的FASTQ数据需要进行质控和预处理,以保证下游分析输入的数据都是干净可靠的。通常我们都是使用FASTQC等软件进行质控,使用cutadapt软件去除接头,使用Trimmomatic等软件进行剪裁,然后使用一些自已开发的脚本进行过滤。这一过程可能…
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2024/12/27 1:59:54