一、实验要求 实验对象：目标体系为modeller或其他方法建模的结果中评价最好的模型。 软件： Gromacs-5.1.2 二、实验步骤 加立场 gmx pdb2gmx –h 打开帮助菜单。 选力场的时候选择 Amber99sb…,溶剂类型选Tip3p。 2、加模拟盒子，溶剂层…

MG-BERT：利用无监督原子表征学习进行分子性质预测 MG-BERT: leveraging unsupervised atomic representation learning for molecular property prediction 本文的第一作者是张小琛博士和吴诚堃研究员。主要合作者来自具有深厚AIDD背景的曹东升教授和侯廷军教授 …

近期，以chatGPT为代表的大语言模型表现非常惊艳。“In Context Learning”、“Instruct”1，以及推理能力，很难不让我们期待未来人工智能的发展，同时冷静思考一下为什么自然语言模型能够取得巨大进步。 文章目录 1 放空大脑从0开始…

分子可以用多种方法表示。本教程介绍一种方法叫做"分子指纹（molecular fingerprint）"，这是一种简单的表示主法，对于小分子类药物来说通常工作得很好。 In [1]: import deepchem as dc dc.__version__ Out[1]: 2.4.…

大家好，今日必读的大模型论文来啦！ 1.苹果推出开放语言模型 OpenELM 大型语言模型（LLMs）的可重复性和透明度，对于推进开放研究、确保结果的可信性、以及对数据和模型偏差以及潜在风险进行调查，至关重要。…

ChemLLM论文介绍，垂直领域模型搭建训练指南(ChemLLM: A Chemical Large Language Model) 返回论文目录 1.论文简介 论文是上海人工智能实验室的工作，想训练一个化学垂直领域的对话大模型，然而现有的化学数据往往是结构性的，所以…

DynamicBind是一个用于蛋白和小分子复合体系构象采样及其打分的等变几何扩散网络。 DynamicBind利用等变几何扩散网络平滑蛋白-小分子复合结构的势能面，以便促进蛋白-小分复合物构象的转化，从而实现高效的采样。DynamicBind 可以从未结合的蛋白质结构中…

本发明属于化工 技术领域： ，具体是一种基于模糊神经网络的化学分子生物毒性预测模型算法。 背景技术： ：近些年来，化学物质合成技术飞快发展，合成物质已经应用于社会的各行各业，随着工业的高度发展，全球化学品的种类和年产量在急剧增长，化学污染物在品种和数量上日益增…